作为第一款全3D即时战略游戏，《家园》的画面和游戏性的确做得十分出色。不过，游戏的操作却由于存在一些问题而令玩家颇有微词。为此，在开发制作《家园2》的过程中，Relic Software不但总结了经验，而且吸取了教训，将游戏的操作设计得更为紧凑和简单。 在操作方面，《家园2》保留了《家园》中的绝大部分设定，只是在细微的地方做了一些更改。不要小看这些细微的变化，它使得游戏的整个操作有所不同。首先，最小的也是最大的变化是游戏视角的改变。Mosquiera说：“为了让玩家对《家园2》更容易上手，我们所做的最关键的一件事情就是改变了游戏的视角。”先前，由于《家园》的视角一直锁定在飞船上，因此当玩家想要移动视角镜头的时候，就不得不先选择想要观看的飞船，然后再将视角镜头锁定在那里，才能继续对周围环境进行观察。这无形中给玩家造成一定的麻烦。因为玩家必须要完成两个步骤才能到达自己的目的。如今，在《家园2》中，虽然该项功能还予以保留，但是玩家如果嫌麻烦，只需要象在其它普通即时战略游戏中那样，将鼠标指针点在屏幕边上，便可以拉动视角镜头，观看战场上的情形，找到自己的部队，并且选择他们下达命令。其次，飞船移动的设定也进行了更改。在前作中，通常的移动手段是先选择飞船，然后使用M键来控制飞船移动。一般情况下，移动一艘飞船需要完成两三步动作。而在《家园2》中，玩家只需要用鼠标右键点击相对的位置，飞船便会沿着水平面移动到那里。如果要沿着垂直面移动，则需要按住鼠标，同时调节高度。当然，玩家如果还是习惯前作中的操作方式，也同样可以使用。 除了上面谈到的两点之外，游戏界面也有所变化。在《家园》中，当玩家想要建造一些设施的时候，必须通过Build Manager来进行。因此，玩家不得不离开太空场景，进入静态的UI屏幕。如今，在《家园2》中，Build Manager成为了游戏屏幕的一部分，使得玩家在游戏中可以同时进行战斗和建设，而不必象从前那样分头进行。
